بررسی ها نشان داده که در گیاهان دارویی علاوه بر ترکیبات عمومی و اساسی هر کدام حداقل دارای یک ماده ی موثره ی ثانویه مخصوص هستند. این مواد موثره ی مخصوص که شامل هزاران نوع می باشند که به مواد طبیعی گیاهی موسوم است. امروزه اکثرا طبقه بندی گیاهان دارویی براساس مواد موثره ی موجود در آنها انجام می شود. به طور کلی مواد طبیعی به دو وسته تقسیم می شوند: